Institució:
pyRMSD és una biblioteca C/Python creada específicament per calcular grans matrius RMSD (desviació arrel quadrada mitjana) per a proteïnes que s'agrupen molt ràpidament; inclou calculadores OpenMP i CUDA (Compute Unified Device Architecture) per a nodes GPU. Això dóna suport directament als fluxos de treball d'acoblament/FEP d'alt rendiment destacats per les tendències del mercat HPC.
pyRMSD és un nucli especialitzat i compatible amb GPU que s'integra perfectament en la tendència de descobriment de fàrmacs impulsada per GPU reduint els temps d'execució de matrius RMSD. L'escalat multinode, l'optimització CUDA moderna i l'empaquetament de programari regulat es poden empaquetar junts per a l'adopció empresarial.
