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pyRMSD es una biblioteca C/Python diseñada específicamente para calcular grandes matrices RMSD (desviación cuadrática media) de proteínas que se ensamblan muy rápidamente; incluye calculadoras OpenMP y CUDA (Compute Unified Device Architecture) para nodos GPU. Esto respalda directamente los flujos de trabajo de acoplamiento/FEP de alto rendimiento que destacan las tendencias del mercado de HPC.
pyRMSD es un kernel especializado, optimizado para GPU, que se integra perfectamente en la tendencia de descubrimiento de fármacos impulsada por GPU al reducir drásticamente los tiempos de ejecución de la matriz RMSD. El escalado multinodo, la optimización CUDA moderna y el empaquetado de software regulado se pueden combinar para su adopción empresarial.
