GREASY

Herramienta diseñada para facilitar el despliegue de simulaciones vergonzosamente paralelas en cualquier entorno

Institución:

Institution

Grupo de investigación:

BSC Group: BSC Operations

Investigador/es:

David Vicente, Jorge Naranjo, Jorge Rodriguez, Xavi Abellan, Christian Simarro

Descripción:

Greasy es un lanzador de tareas ligero que agrupa miles de réplicas independientes de acoplamiento/FEP/MD en una única tarea por lotes altamente paralela, aprovechando al máximo cada ciclo de GPU de una cola HPC al permitir un cribado más rápido.

Greasy es una utilidad de orquestación de cargas de trabajo HPC que apoya indirectamente varias tendencias de HPC en el sector sanitario al maximizar la eficiencia del clúster para tareas altamente paralelas. La contenerización, la planificación con reconocimiento de GPU y los ganchos de cumplimiento lo convertirán en un acelerador plug-and-play para equipos de descubrimiento de fármacos y análisis de biobancos.

Propuesta de valor:

Ejecuta mil millones de poses de acoplamiento durante la noche sin reescribir los scripts.

Áreas de aplicación:

Descubrimiento de fármacos, desarrollo de fármacos

Mercado objetivo:

Farmacéuticas

Protection:

GPL License (Version 3.0)

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