Caracterización FRET de conjuntos de proteínas y unión proteína-ligando

Evaluación de sitios/modos de unión proteína-ligando y preferencias conformacionales de proteínas a través de experimentos FRET y simulaciones multiescala

Institución:

Institution

Grupo de investigación:

Computational Photobiology Lab (CPL)

Investigador/es:

Carles Curutchet
Özge Ergün

Caracterización FRET de conjuntos de proteínas y unión proteína-ligando

Descripción:

Simulación basada en estructura de las propiedades de transferencia de energía resonante de Förster (FRET) a partir de trayectorias de dinámica molecular (MD) combinadas con modelos QM/MM polarizables para estados excitados, y posterior validación de los conjuntos conformacinales de MD mediante la comparación de eficiencias FRET experimentales y simulada

Tipo de activo:

Servicio

Categoría:

Life Sciences

Problema:

Validar modelos estructurales atomísticos de unión proteína-ligando y conjuntos conformacionales de proteínas

Solución:

Validar modelos estructurales mediante experimentos y simulaciones FRET

Áreas de aplicación:

Diseño de fármacos basado en la estructura

Novedad:

Validación de conjuntos conformacionales de MD con experimentos FRET basados en la comparación directa de propiedades espectroscópicas, no en la comparación de distancias dador-aceptor derivadas experimentalmente con la aproximación de Förster

Protección:

N/A

Mercado objetivo:

Empresas farmacéuticas y biotecnológicas

TRL: 2

CRL: 2

BRL: 1

IPRL: 1

TmRL: 2

FRL: 3

Impacted SDGs:
N/A

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